海船船员健康证明有效期满的，海船船员应重新申请海船船员健康证明。海船船员健康证明在航行中有效期期满的，在到达下一个有缔约国认可的从业医生的停靠港之前该健康证书仍然有效，但为期不得超过3个月。
在紧急情况下，海事管理机构可允许持有近日过期的海船船员健康证明的海船船员工作至下一个具有缔约国认可从业医生的港口，但许可的期限不得超过3个月。

沿海船员，只要健康证过期的，海事检查人员一般都要求船员获得体检健康证后才能够开船，远洋船员则有一定延期时间的。简单讲，健康证过期会要求马上补办或者严重会被罚款、船舶滞留。